在最後的浪人擊敗腳幫的十多年後，紐約市發現自己正處於不斷衰落的狀態。現在，不同的幫派都在爭奪經濟和政治控制權，混亂的局面正在使他們付出代價凱茜·瑪麗清楚地意識到，如果不儘快採取措施，她所熟悉和熱愛的城市將永遠消失。因此，無論他們是否準備好，她和她年輕的學生們都必須組建新的聯盟，帶頭維護和平。見證下一代忍者神龜的崛起，他們為恢復和平而戰！